Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
4930579F01RikE9Q3L6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930579F01RikE9Q3L6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms