Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEDD8-MDP1E9PL57 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEDD8-MDP1E9PL57 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms