Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atp2c2A7L9Z8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atp2c2A7L9Z8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms