Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herc3A6H6S0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herc3A6H6S0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Herc3A6H6S0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms