Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CtcflA2APF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtcflA2APF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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