Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930447F04RikA2AFR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms