Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbf1A2A870 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbf1A2A870 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms