Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc112A0AUP1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc112A0AUP1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc112A0AUP1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms