Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20792A0A087WRF5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20792A0A087WRF5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20792A0A087WRF5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20792A0A087WRF5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20792A0A087WRF5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm20792A0A087WRF5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20792A0A087WRF5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm20792A0A087WRF5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20792A0A087WRF5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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