Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
D17h6s53eQ9Z1R4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms