Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARP3Q9Y6F1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PARP3Q9Y6F1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PARP3Q9Y6F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms