Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cry2Q9R194 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cry2Q9R194 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cry2Q9R194 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms