Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SrpxQ9R0M3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrpxQ9R0M3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms