Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mid2Q9QUS6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mid2Q9QUS6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms