Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL20A1Q9P218 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL20A1Q9P218 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms