Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
LRRC4Q9HBW1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC4Q9HBW1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms