Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrnb2Q9ERK7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrnb2Q9ERK7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.7 ms