Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rpgrip1Q9EPQ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rpgrip1Q9EPQ2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms