Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PudpQ9D5U5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PudpQ9D5U5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms