Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4933402D24RikQ9D4D3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4933402D24RikQ9D4D3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms