Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syce1Q9D495 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syce1Q9D495 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syce1Q9D495 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms