Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ms4a4cQ9D3F6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms