Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhdc8bQ9D2D9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms