Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ss18l2Q9D174 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ss18l2Q9D174 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ss18l2Q9D174 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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