Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atg12Q9CQY1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms