Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PsenenQ9CQR7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PsenenQ9CQR7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms