Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CEP44Q9C0F1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CEP44Q9C0F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms