Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scd3Q99PL7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Scd3Q99PL7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms