Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms