Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC7

Smagp, Small cell adhesion glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmagpQ99KC7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SmagpQ99KC7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SmagpQ99KC7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms