Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EpcamQ99JW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EpcamQ99JW5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms