Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COPS8Q99627 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COPS8Q99627 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms