Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC00301Q8NCQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC00301Q8NCQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms