Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rnf208Q8K0W3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rnf208Q8K0W3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf208Q8K0W3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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