Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdkl1Q8CEQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms