Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS47

9430097D07Rik, RIKEN cDNA 9430097D07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9430097D07RikQ8BS47 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
9430097D07RikQ8BS47 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
9430097D07RikQ8BS47 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms