Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc1Q80VQ1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrrc1Q80VQ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrrc1Q80VQ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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