Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nphp3Q7TNH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphp3Q7TNH6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphp3Q7TNH6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms