Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Gapvd1Q6PAR5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gapvd1Q6PAR5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Gapvd1Q6PAR5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Gapvd1Q6PAR5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms