Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REEP3Q6NUK4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
REEP3Q6NUK4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms