Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nhlh2Q64221 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nhlh2Q64221 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms