Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vil1Q62468 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vil1Q62468 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vil1Q62468 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms