Protein–RNA interactions for Protein: Q62457

Gm20917, (clone BALB8N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20917Q62457 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm20917Q62457 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20917Q62457 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms