Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa13Q62424 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Hoxa13Q62424 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa13Q62424 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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