Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Taf6Q62311 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Taf6Q62311 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms