Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrn1Q61809 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lrrn1Q61809 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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