Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trpc1Q61056 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Trpc1Q61056 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trpc1Q61056 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trpc1Q61056 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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