Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf123Q5XPI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf123Q5XPI3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf123Q5XPI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms