Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF18Q5VWM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF18Q5VWM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms