Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med13Q5SWW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med13Q5SWW4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms